As lagoas de estabilização projetadas, construídas e operadas adequadamente permitem a redução de seis ordens de magnitude de bactérias e três ordens de magnitude de nematoides, sendo um sistema ideal para reúso de seus efluentes de esgoto sanitário na irrigação. Sendo assim, pode-se citar como uma vantagem do uso de sistemas de lagoas de estabilização, EXCETO:
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A Têm elevada estabilização de matéria orgânica e se adaptam facilmente a variações sazonais.
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B Produzem efluentes de qualidade média, com uma redução baixa de micro-organismos patogênicos.
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C Podem tratar despejos industriais facilmente biodegradados, como de matadouros, laticínios e industrialização de frutas.
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D Apresentam baixo custo, com facilidade de serem construídos e operados, além de consumo energético nulo durante a sua operação.